ML4HOR
Apprentissage automatique pour les résultats de santé avec R
ML4HOR
Apprentissage automatique pour les résultats de santé avec RPrédiction
Description du cours
ML4HOR offre une introduction pratique à l’apprentissage automatique pour la recherche sur les résultats de santé avec R. Le cours couvre le flux complet d’apprentissage supervisé et explore le clustering comme extension finale pour le phénotypage des patients, la découverte de sous-groupes, et l’analyse exploratoire des données de santé.
Le cours met l’accent sur la validation, la prévention des fuites de données, les mesures de performance appropriées, la calibration, l’interprétabilité, la pertinence clinique, et le rapport reproductible.
Objectifs d’apprentissage
À l’issue de ML4HOR, les participants seront capables de :
- formuler des questions d’apprentissage automatique en recherche sur les résultats de santé ;
- préparer des jeux de données tabulaires de santé pour l’analyse ML ;
- ajuster des modèles supervisés ;
- évaluer des modèles par validation par rééchantillonnage ;
- régler et comparer les modèles de manière équitable ;
- évaluer la discrimination, la calibration et l’utilité clinique ;
- interpréter les modèles ML avec des méthodes d’explication globales et locales ;
- appliquer le clustering au phénotypage des patients et à la découverte de sous-groupes ;
- distinguer prédiction, clustering et estimation causale ;
- produire un rapport ML reproductible avec Quarto.
Calendrier
| N° | Sujet |
|---|---|
| 1 | Introduction au ML pour les résultats de santé & flux de travail R/Quarto |
| 2 | Rééchantillonnage et mesures de performance |
| 3 | Modèles linéaires et régularisés |
| 4 | Arbres, forêts aléatoires, boosting & ensembles |
| 5 | Réglage des hyperparamètres, sélection et comparaison de modèles |
| 6 | Calibration et utilité clinique |
| 7 | Interprétation des modèles, explicabilité & clustering pour le phénotypage |
| 8 | Pipeline ML de bout en bout et mini-projet |
Informations pratiques
- Public
- Chercheurs, doctorants, cliniciens, professionnels de la santé publique, analystes de données
- Prérequis
- R de base et culture statistique recommandés, comme couvert dans BIOSTATR
- Format
- Séances en direct, diapositives, notebooks, jeux de données, exercices
- Horaire
- Lun/mer/ven 18h00–20h00, dim 10h00–12h00 (heure du Maroc)
- Outils
- R, RStudio, Quarto
- Évaluation
- Mini-projet Quarto reproductible
- Étape suivante
- SURV4CR ou METAR