SURV4CR
SURV4CR
Analyse de survie pour la recherche clinique avec RÉvénements/temps
Description du cours
SURV4CR offre une introduction pratique et méthodologiquement rigoureuse à l’analyse de survie pour la recherche clinique avec R. Il couvre le flux complet d’analyse des données de survie : structure des données, censure, estimation de Kaplan-Meier, tests du log-rank, régression de Cox, diagnostics des risques proportionnels, risques concurrents, RMST, apprentissage automatique de survie, RMST dynamique, et phénotypage temporel.
Le cours met l’accent sur l’interprétation clinique, la gestion correcte de la censure, les hypothèses des modèles, la reproductibilité, et l’utilisation responsable de l’apprentissage automatique pour les données de survie.
Objectifs d’apprentissage
À l’issue de SURV4CR, les participants seront capables de :
- définir l’origine temporelle, l’événement, le temps de suivi et le mécanisme de censure ;
- structurer des données de survie avec R ;
- estimer et interpréter les courbes de Kaplan-Meier et réaliser des tests du log-rank ;
- ajuster et évaluer des modèles de Cox à risques proportionnels, y compris diagnostics et extensions ;
- analyser les risques concurrents avec l’incidence cumulée et les modèles de Fine-Gray ;
- utiliser la RMST comme estimande de survie cliniquement interprétable ;
- ajuster, évaluer et interpréter des modèles d’apprentissage automatique de survie ;
- calculer des courbes de RMST dynamique et appliquer le clustering temporel pour le phénotypage de survie ;
- produire un rapport d’analyse de survie reproductible.
Calendrier
| N° | Sujet |
|---|---|
| 1 | Structure des données de survie, plan d’étude & Kaplan-Meier/log-rank |
| 2 | Modèle de Cox à risques proportionnels |
| 3 | Extensions du modèle de Cox (stratifié, covariables dépendantes du temps, fragilité) |
| 4 | Risques concurrents et modèles paramétriques flexibles |
| 5 | La RMST comme estimande clinique |
| 6 | ML de survie : fondations, évaluation & réglage |
| 7 | Interprétation du ML de survie, RMST dynamique & phénotypage temporel |
| 8 | Projet d’analyse de survie de bout en bout |
Informations pratiques
- Public
- Cliniciens, chercheurs cliniques, épidémiologistes, doctorants, analystes travaillant avec des données de suivi
- Prérequis
- R de base et régression recommandés, comme couvert dans BIOSTATR
- Format
- Séances en direct, diapositives, notebooks, jeux de données, exercices
- Horaire
- Lun/mer/ven 18h00–20h00, dim 10h00–12h00 (heure du Maroc)
- Outils
- R, RStudio, Quarto
- Évaluation
- Mini-projet Quarto reproductible
- Étape suivante
- METAR